Наконец получен долгожданный приказ: "... на поиск и уничтожение кораблей противника". В первом же боевом походе 14 августа 1942 подводники потопили немецкий транспорт "Хелена" водоизмещением 7000 тонн. Этот подвиг достоин искреннего удивления: преследования вражескими катерами, когда лодка-малютку бросало взрывами в морских глубинах; 20 линий подводных минных заграждений, которые, трижды скрежеща корпусом об смертоносный барьер, прошла пострадала в поединке субмарина; ложный нападение своих, когда трагическому исходу удалось избежать, опять же, благодаря решительным действиям командира: внезапно вигулькнувшы лодкой среди раз атакующими советскими катерами, ему удалось остановить азартных "охотников" ...
За этот поход Маринеско 13 ноября 1942 был отмечен первой наградой в войну - орденом Ленина. Ему присваивают звание капитана 3-го ранга и направляют ... в Самарканд для повышения квалификации, куда были эвакуированы Военно-морскую академию! Маринеско раз был лишен возможности воевать. Он болезненно переживал полтора года бездействия (обучение не было таким уж очень необходимым), особенно удручало то, что его "М-96" ("заколдованный" при его командовании) погиб. В 1944 г. от тяжелых ран умирает отец.
... Поединок с "Зигфридом", мощным немецким транспортникам, был долгим и утомительным. Его командир оказался опытным моряком: уклонившись от четырех торпед с "С-13", в конце отчаянно пошел на таран. Маринеско скомандовал немедленно всплыть и огнем пушки и пулемета сумел пустить фашистский корабль на дно. За этот поединок подводника наградили орденом Боевого Красного Знамени.